Metabolomika biologických systémů
Metabolomika je relativně nový vědní obor zabývající se analýzou metabolomu, souboru všech nízkomolekulárních látek (zpravidla menších než 1 500 Da) v živých organismech i mimo ně. Tato analýza představuje výzvu z hlediska vysoké časové dynamiky metabolomu i značně odlišných koncentrací metabolitů. Znalost metabolomu a jeho změn v souvislosti s různými jevy (patologické stavy organismu, změněná výživa, různé kultivary rostlin) však často může přinést klíčové poznatky pro pochopení těchto jevů.
Naše skupina se zabývá analýzou metabolomu převážně biologických vzorků (tělní tekutiny, tkáně) ale i rostlin, a popisu změn metabolomu v souvislosti s řadou jevů. Pro analýzu metabolomu využíváme řadu hmotnostně-spektrometrických technik, často ve spojení s chromatografickými metodami, které nám umožňují identifikovat jednotlivé metabolity které jsou asociovány se studovanými změnami v organismech.
Související publikace
- Bechynska K., Daskova N., Vrzackova N., Harant K., Heczkova M., Podzimkova K., Bratova M., Dankova H., Berkova Z., Kosek V., Zelenka J., Hajslova J., Sedlacek R., Suttnar J., Hlavackova A., Bartonova L., Cahova M.: The effect of omega-3 polyunsaturated fatty acids on the liver lipidome, proteome and bile acid profile: parenteral versus enteral administration. Scientific Reports (2020) 9: 19097. (doi: 10.1038/s41598-019-54225-8)
- Kosek V., Heczkova M., Novak F., Meisnerova E., Novakova O., Zelenka J., Bechynska K., Vrzacova N., Suttnar J., Hlavackova A., Dankova H., Bratova M., Daskova N., Malinska H., Oliyarnyk O., Wohl P., Bastova H., Cahova M.: The ω-3 polyunsaturated fatty acids and oxidative stress in long-term parenteral nutrition dependent adult patients: Functional lipidomics approach. Nutrients (2020) 12(8) 2351. (doi: 10.3390/nu12082351)
Projekty:
AZV
- NU21-01-00259: Nové inhibitory lipolýzy v léčbě poruch metabolismu lipidů a glukózy při syndromu obstrukční spánkové apnoe (2021 – 2024)
- NV18-08-00149: Kritické zhodnocení lipidomu u pacientů s akutním koronárním syndromem a cévní mozkovou příhodou ve vztahu ke stupni oxidačního stresu (2018 – 2021)