Metabolomika biologických systémů
Metabolomika je relativně nový vědní obor zabývající se analýzou metabolomu, souboru všech nízkomolekulárních látek (zpravidla menších než 1 500 Da) v živých organismech i mimo ně. Tato analýza představuje výzvu z hlediska vysoké časové dynamiky metabolomu i značně odlišných koncentrací metabolitů. Znalost metabolomu a jeho změn v souvislosti s různými jevy (patologické stavy organismu, změněná výživa, různé kultivary rostlin) však často může přinést klíčové poznatky pro pochopení těchto jevů.
Naše skupina se zabývá analýzou metabolomu převážně biologických vzorků (tělní tekutiny, tkáně) ale i rostlin, a popisu změn metabolomu v souvislosti s řadou jevů. Pro analýzu metabolomu využíváme řadu hmotnostně-spektrometrických technik, často ve spojení s chromatografickými metodami, které nám umožňují identifikovat jednotlivé metabolity které jsou asociovány se studovanými změnami v organismech.
Související publikace
- Uttl L., Bechynska K., Ehlers M., Kadlece V., Navratilova K., Dzuman Z., Fauhl-Hassek C., Hajslova J.: Critical assessment of chemometric models employed for varietal authentication of wine based on UHPLC-HRMS data. Food Control (2023) 143: 109336. (doi: 10.1016/j.foodcont.2022.109336)
- Fiserova I., Trinh M.D., Elkalaf M., Vacek L., Heide M., Martinkova S., Bechynska K., Kosek V., Hajslova J., Fiser O., Tousek P., Polak J.: Isoprenaline modified the lipidomic profile and reduced β-oxidation in HL-1 cardiomyocytes: In vitro model of takotsubo syndrome. Frontiers in Cardiovascular Medicine (2022) 9:917989. (doi: 10.3389/fcvm.2022.917989)
- Garcia C.J., Kosek V., Beltran D., Tomas-Barberan F.A., Hajslova J.: Production of New Microbially Conjugated Bile Acids by Human Gut Microbiota. Biomolecules (2022) 12(5): 687. (doi: 10.3390/biom12050687)
- Kosek V., Hajsl M., Bechynska K., Kucerka O., Suttnar J., Hlavackova A., Hajslova J., Maly M.: Long-Term Effects on the Lipidome of Acute Coronary Syndrome Patients. Metabolites (2022) 12(2): 124. (doi: 10.3390/metabo12020124)
- Smid V., Dvorak K., Sedivy P., Kosek V., Lenicek M., Dezortova M., Hajslova J., Hajek M., Vitek L., Bechynska K., Bruha R.: Effect of Omega-3 Polyunsaturated Fatty Acids on Lipid Metabolism in Patients With Metabolic Syndrome and NAFLD. Hepatology Communications (2022) 6(6): 1336-1349. (doi: 10.1002/hep4.1906)
- Vacek L., Dvorak A., Bechynska K., Kosek V., Elkalaf M., Trinh M.D., Fiserova I., Pospisilova K., Slovakova L., Vitek L., Hajslova J., Polak J.: Hypoxia Induces Saturated Fatty Acids Accumulation and Reduces Unsaturated Fatty Acids Independently of Reverse Tricarboxylic Acid Cycle in L6 Myotubes. Frontiers in Endocrinology (2022). 13: 663625. (doi: 10.3389/fendo.2022.663625)
- Bechynska K., Kosek V., Fenclova M., Muchova L., Smid V., Suk J., Chalupsky K., Sticova E., Hurkova K., Hajslova J., Vitek L., Stranska M.: The Effect of Mycotoxins and Silymarin on Liver Lipidome of Mice with Non-Alcoholic Fatty Liver Disease. Biomolecules (2021) 11: 1723. (doi: 10.3390/biom11111723)
- Bechynska K., Kosek V., Zlechovcova M., Peukertova P., Hajlsova J.: Cannabis Metabolomic Data Processing: Challenges to be Addressed. LCGC (2021) Special Issues 34(s10): 11-15. (on-line)
- Birse N., Chevallier O., Hrbek V., Kosek V., Hajslova J., Elliot Ch.: Ambient mass spectrometry as a tool to determine poultry production system history: A comparison of rapid evaporative ionisation mass spectrometry (REIMS) and direct analysis in real time (DART) ambient mass spectrometry platforms. Food Control (2021). 123: 107740 (doi: 10.1016/j.foodcont.2020.107740)
- Maly M., Hajsl M., Bechynska K., Kucerka O., Sramek M., Suttnar J., Hlavackova A., Hajslova J., Kosek V.: Lipidomic analysis to assess oxidative stress in acute coronary syndrome and acute stroke patients. Metabolites (2021) 11(7): 412. (doi: 10.3390/metabo11070412)
- Bechynska K., Daskova N., Vrzackova N., Harant K., Heczkova M., Podzimkova K., Bratova M., Dankova H., Berkova Z., Kosek V., Zelenka J., Hajslova J., Sedlacek R., Suttnar J., Hlavackova A., Bartonova L., Cahova M.: The effect of omega-3 polyunsaturated fatty acids on the liver lipidome, proteome and bile acid profile: parenteral versus enteral administration. Scientific Reports (2020) 9: 19097. (doi: 10.1038/s41598-019-54225-8)
- Kosek V., Heczkova M., Novak F., Meisnerova E., Novakova O., Zelenka J., Bechynska K., Vrzacova N., Suttnar J., Hlavackova A., Dankova H., Bratova M., Daskova N., Malinska H., Oliyarnyk O., Wohl P., Bastova H., Cahova M.: The ω-3 polyunsaturated fatty acids and oxidative stress in long-term parenteral nutrition dependent adult patients: Functional lipidomics approach. Nutrients (2020) 12(8) 2351. (doi: 10.3390/nu12082351)
Projekty:
AZV
- NU22-04-00389: Vliv metabolomu aterosklerotického plátu v karotidě na jeho embolizační potenciál (2022 - 2025)
- NU21-01-00259: Nové inhibitory lipolýzy v léčbě poruch metabolismu lipidů a glukózy při syndromu obstrukční spánkové apnoe (2021 – 2024)
- NV18-08-00149: Kritické zhodnocení lipidomu u pacientů s akutním koronárním syndromem a cévní mozkovou příhodou ve vztahu ke stupni oxidačního stresu (2018 – 2021)